diff --git a/src/deps/init_deps.sh b/src/deps/init_deps.sh
index bf5c26451..233300b94 100755
--- a/src/deps/init_deps.sh
+++ b/src/deps/init_deps.sh
@@ -56,6 +56,10 @@ do
     do_and_check_cmd git subtree pull --prefix "src/deps/src/$id" "$url" "$commit" --squash
 	fi
 
+  if [ -f "src/deps/src/$id/.gitmodules" ] ; then
+    do_and_check_cmd git submodule init --recursive -- "src/deps/src/$id"
+  fi
+
   if [ -d "src/deps/src/$id/.git" ] ; then
     do_and_check_cmd rm -rf "src/deps/src/$id/.git"
   fi